Команда Шеппарда тихо-мирно возвращалась с задания по проверке некой планеты на предмет ее использования в качестве вспомогательной базы. Неожиданно все системы джампера взбесились и отказали. МакКей из всех сил, но тщетно пытался восстановить хоть что-то, но компьютер отказывался подчиняться. Так же внезапно все системы пришли в норму и управление кораблем вернулось к Джону. Со второй попытки удалось вернуться на Атлантис, но случившееся с джампером вызвало вполне логичный переполох. Особенно загадочным был факт, что последующая диагностика не выявила никаких неполадок в системах. Однако через какое-то время после возвращения аналогичные проблемы возникли во всех системах города. Финальным аккордом стало отключение всего энергообеспечения. Когда после этого внезапно загрузился компьютер, естественно все устремились к нему. После нескольких бессмысленных наборов букв на экране появилось слово «помогите».

МакКей тут же вступил в беседу с вирусом, поселившимся в компьютерах города, и этот вредитель сообщил, что зовут его Элизабет Вейр. Атлантийцы отнеслись к заявлению скептически, но Родни все-таки произвел некоторые настройки, чтобы облегчить общение – в частности, подсоединил к компьютеру синтезатор речи. Это позволило «вирусу» рассказать, почему он себя считает доктором Вейр.

После того, как атлантийцам пришлось оставить Элизабет на Асурасе, репликаторы разблокировали ограничения в программе ее нанитов, которые сделал МакКей (см. 402 – Lifeline). После этого асуранцы ассимилировали ее. Тем не менее, сознание Вейр все еще оставалось ключевой частью нового репликатора, и некоторые из них это чувствовали – так она стала членом секты последователей Ниама, которые стремились к вознесению. Вместе с ними она оказалась в бегах как раз в тот момент, когда атлантийцы одержали победу над репликаторами (см. 411 – Be All My Sins Remember’d).

Это позволило ее группе спокойно продолжить свой путь к вознесению. Однако, как оказалось, терпением репликаторы не наделены, поэтому даже под руководством Элизабет путь к вознесению через медитации им быстро наскучил. Корасен, один из членов секты, изобрел способ переноса сознания репликаторов в подпространство, в надежде, что тогда уже им ничто не помешает перейти на следующий уровень бытия. Несмотря на опасения, последователи Ниама все же пошли на этот шаг и сильно ошиблись. Существовать в подпространстве оказалось очень тяжело, и к вознесению их это не приблизило. Тогда они начали искать способ вернуться к физическому существованию. Они нашли множество технологически развитых рас в Пегасе (о как!), но ни одна не могла им ничего предложить. Поэтому Элизабет отделилась от остальных репликаторов и начала искать способ попасть в Атлантис. В конце концов ей это удалось, когда она встретила джампер Шеппарда. (Странно это все, конечно. Значит, кучу тайных развитых рас они нашли легко, а атлантийцев, которые в каждой бочке затычка, еле отыскали. Ну, да ладно...) Вейр извинилась за неполадки, которые она вызвала, пока подстраивалась к системам, и попросила атлантийцев выдать ей новое репликаторное тело.

Мнения по поводу услышанного разделились: некоторые хотели верить, что действительно имеют дело с сознанием Элизабет, некоторые (во главе с Вулси) склонны были считать это очередным трюком репликаторов. Пока они спорили, техники зафиксировали всплеск энергии в репликаторной лаборатории города, и отключить ее никак не удавалось. Когда команда Шеппарда в сопровождении Вулси прибыла на южный пирс, двери лаборатории открылись, и оттуда вышла Френ – Вейр воспользовалась этой формой, потому что создавать новую времени не было. (Ну, понятное дело, если бы Торри Хиггинсон согласилась играть в этой серии, то и время бы нашлось – ведь форму можно было создать и до активации лаборатории, втайне от атлантийцев.)

Этот поступок еще больше усилии подозрения, в теле Френ находится вовсе не доктор Вейр, и чтобы доказать обратное, Элизабет загрузила на компьютер МакКея информацию о технологически развитых расах Пегаса. Это, конечно, не сильно помогло, и атлантийцы продолжили думать, как поступить с репликатором. И тут последовал неожиданный поворот событий: Френ/Вейр почувствовала, что остальные последователи Ниама нашли ее и направляются в город. Никаких мер предосторожности Родни придумать не успел, а системы Атлантиса снова оказались во власти бестелесных репликаторов. Они сообщили, что хотят получить физические тела, как у нее, и когда Вулси им отказал, асуранцы начали затапливать город. Но Ричард уступать не собирался и был готов уничтожить Атлантис вместе с экспедицией и репликаторами. Поняв это, последователи Ниама остановили затопление и согласились на компромисс, предложенный Вейр: атлантийцы дают незваным гостям временные репликаторные тела, а они воспроизводят технологию для создания тел из плоти и крови (как была скопирована команда Шеппарда в 410 – This Mortal Coil), куда впоследствии они переместят свои сознания. Вулси не был в восторге от этой идеи, но ему пришлось согласиться.

Репликаторы приступили к работе в запертой лаборатории, под силовым полем, охраной отряда морпехов и острым взглядом Ронона. Но все оказалось зря: через некоторое время Корасен отключил силовое поле и вырвался из-под охраны, не собираясь переселяться в бренное тело. Остальные асуранцы клялись, что были не в курсе планов отщепенца. Шеппард им не очень поверил, но уничтожение решил отсрочить, кинувшись вслед за Корасеном и Френ/Вейр, которая тоже решила поймать беглеца. После быстротечной стычки двое-на-одного Корасен был уничтожен, а Элизабет в итоге осознала, что любая форма репликаторов все-таки опасна для людей. Нужно было придумывать другой выход.

Вейр сообщила своим нынешним соратникам, что дальнейшие работы по созданию человеческих тел они продолжат на другой планете, чтобы не подвергать опасности Атлантис. Репликаторы пообещали, что не будут отходить от плана и контактировать с какими-либо другими расами. Элизабет первая прошла через врата, грустной улыбкой простившись с бывшей командой. Остальные асуранцы последовали за ней, получив сигнал, что никакой опасности нет. И выходя из врат они оказывались в открытом космосе на орбите безымянной планеты...